More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4007 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  42.74 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  42.68 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  42.37 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  36.55 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  34.82 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  37.02 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  34.09 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  34.48 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.92 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  34.18 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  34.89 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  35.18 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  34.94 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  31.34 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  32.65 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  32.2 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  35.19 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 254 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  29.1 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.95 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  29.85 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.5 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.02 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.99 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  28.07 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  31.34 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.18 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.96 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>