More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0840 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  40.24 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  39.15 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  39.57 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  39.82 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  35.71 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  36.63 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.77 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  34.36 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  35.1 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  38.93 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  34.32 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  32.53 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.74 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  30.83 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  32.34 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  25.2 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.19 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  32.13 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.31 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  31.2 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.35 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  27.96 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.62 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  26.47 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  25.93 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>