More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6282 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  41.39 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  39.32 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  35.02 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.77 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  34.57 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.43 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  31.67 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  29.91 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 289 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  27.64 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  34.57 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  28.19 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  30.25 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 304 aa  92  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  33.06 
 
 		 302 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 292 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 292 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  27.41 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  34.3 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  27.97 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  31.3 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  31.98 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  29.55 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  31.69 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  25.51 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  25.82 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.76 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.86 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.94 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  24.5 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.25 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.29 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.56 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.86 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.67 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  27.27 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  26.54 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.43 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.25 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>