More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0296 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 258 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  64.73 
 
 		 258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  63.71 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  63.71 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 258 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  47.84 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2707  regulatory protein IclR  47.81 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  46.38 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2088  transcriptional regulator, IclR family  47.88 
 
 		 273 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2426  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.172825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  43.97 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  48.29 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4650  IclR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5789  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5796  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.27 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.27 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.27 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.19 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.64 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.55 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.33 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  28.24 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.53 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.8 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  26.59 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  27.84 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.1 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  30.2 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.72 
 
 		 273 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>