More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6503 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  55.21 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  56.7 
 
 		 292 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  56.25 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  53.88 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  54.44 
 
 		 279 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  42.19 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  39.27 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  39.42 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  39.38 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  37.22 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  36.21 
 
 		 285 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  34.17 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.37 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  34.45 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.49 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.94 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.02 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.49 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  26.45 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  36.44 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  32.54 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  34.38 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.44 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.03 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.46 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.16 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  24.69 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.67 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.83 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  29.75 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  29.63 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  25.23 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  21.78 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.63 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.78 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  34.13 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  27.97 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.57 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>