More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4440 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 288 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  52.85 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  56.42 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 292 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 295 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  55.38 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  55.38 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  54.18 
 
 		 271 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.72 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  31.73 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  33.6 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  34.87 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  32.38 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.07 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  30.4 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  31.82 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  31.55 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  32.68 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.91 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  27.64 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.07 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.97 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  25.44 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.51 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  30.09 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 250 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  29.22 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 550 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.78 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>