297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0905 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  35.02 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  37.61 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  33.91 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  35.02 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  31.91 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 292 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 304 aa  95.1  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  31.58 
 
 		 290 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  31.11 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 286 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 302 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  30.93 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  30.99 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  31 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.25 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  32.07 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  30 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  28.75 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.13 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  30.22 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  27.5 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.11 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  24.68 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  26.49 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  22.78 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  26.82 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  26.82 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  24.29 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  26.5 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  28.69 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.42 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  25.77 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>