More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4994 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 308 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  37.82 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 295 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.6 
 
 		 252 aa  91.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 265 aa  91.7  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 		 255 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.98 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.38 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 280 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.84 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 262 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 269 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 278 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.4 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.82 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.76 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  29.96 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.14 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>