More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8325 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  92.74 
 
 		 234 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 250 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  40.25 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  41.52 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  41.52 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  39.66 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  34.55 
 
 		 270 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  33.19 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 196 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  29.74 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.87 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  26.12 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.39 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  26.53 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  22.63 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.74 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  30.51 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.76 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  26.61 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  21.4 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  27.54 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  29.22 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  29.52 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  26.27 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>