More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4803 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  97.79 
 
 
272 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  97.79 
 
 
272 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  88.81 
 
 
273 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  88.43 
 
 
273 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  73 
 
 
251 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  44.31 
 
 
254 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  47.69 
 
 
264 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  47.69 
 
 
264 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.89 
 
 
231 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
243 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
258 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 
266 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
249 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
248 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
234 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  42.21 
 
 
234 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
242 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
247 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  41.23 
 
 
246 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  39.25 
 
 
270 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  37.2 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
236 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
242 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
236 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
236 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
236 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  36.16 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
241 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
237 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 
239 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  38.97 
 
 
233 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
238 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 
241 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 
236 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
233 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 
233 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 
236 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 
233 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  34.26 
 
 
233 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  35.02 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  33.8 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  34.86 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  33.18 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
239 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  33.8 
 
 
233 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
255 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 
233 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  35.02 
 
 
238 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  35.44 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  33.33 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
283 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
250 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  33.95 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  28.79 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  33.04 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.51 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.78 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.18 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25.44 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  27.76 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.87 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>