More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3982 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  81.28 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  78.39 
 
 		 236 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  77.97 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  77.54 
 
 		 236 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  77.97 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  41.52 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.48 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  36.12 
 
 		 334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  38.86 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 272 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  33.04 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  30.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  29.88 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  29.86 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  29.38 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.58 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  23.17 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  33.96 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  28.8 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  24.49 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>