More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0625 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  84.81 
 
 		 244 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  78.33 
 
 		 241 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  74.79 
 
 		 238 aa  348  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  74.37 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  74.79 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  72.5 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  74.58 
 
 		 239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  72.27 
 
 		 246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  73.11 
 
 		 239 aa  334  9e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  71.25 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  70.83 
 
 		 239 aa  331  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  69.17 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  73.82 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  67.08 
 
 		 239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  63.56 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  66.23 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  71.3 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  63.44 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  60.68 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  56.81 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  56.81 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  57.28 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  57.28 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  57.92 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  54.93 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  57.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  57.08 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  57.08 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  55.9 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  54.08 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  36.02 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.06 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  38.14 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.5 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  34.35 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.93 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.53 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  30.21 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  24.79 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.45 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  23.95 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>