More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1720 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  73.86 
 
 
249 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  73.03 
 
 
249 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  45.41 
 
 
254 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  42.15 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  42.15 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.36 
 
 
231 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
258 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
248 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
272 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
273 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
273 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
272 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
272 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
243 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
250 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
247 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
234 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
266 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 
234 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 
246 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  37.38 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  37.89 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
236 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
236 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
236 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
236 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 
240 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
241 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
238 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
236 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
236 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  32.33 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.05 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 
233 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  24.59 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  31.03 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  24.59 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  30.7 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  28.69 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  30.17 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  22.76 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  30.36 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  29.22 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  31.85 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  31.7 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>