More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4247 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  91.34 
 
 		 233 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  81.82 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  81.82 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  47.09 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  35.33 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  34.88 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  40.88 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  35.71 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.96 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  32.34 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.59 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.35 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.35 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.35 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32.34 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  28.42 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  22.93 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.51 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  29.85 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  22.93 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.83 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  28.42 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  28.42 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.63 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  31.51 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.67 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.75 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.41 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>