More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1914 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  48.43 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  52 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 254 aa  131  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  39.91 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  38.81 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  35.33 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  34.81 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  37.14 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  37.14 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  38.57 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  35.62 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  41.67 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  39.39 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.51 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  32.49 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.65 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  29.39 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.65 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 278 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0667  regulatory protein IclR  30.23 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.23 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  34.83 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  32.84 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>