More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2434 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  47.93 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  40.33 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  40.24 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  39.43 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  39.3 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  36.44 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  36.86 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  39.29 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  35.11 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  30.83 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  31.34 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 324 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.1 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  25.95 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>