More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2281 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  41.63 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  38.74 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  40.49 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  39.84 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  37.7 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  37.93 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  35.91 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 258 aa  142  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  30.4 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 254 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.03 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.55 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.34 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  24.36 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.27 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.67 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  23.75 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.89 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  24 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.42 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  25.38 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.41 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  24.88 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.72 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.55 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  24.03 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  20.87 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  24.63 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>