More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6756 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  38.25 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  37.35 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  38.81 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  33.47 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  29.65 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.54 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  23.74 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.17 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  24.75 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  26.17 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  27.44 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.48 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  25 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>