More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02755 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  39.42 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  39.2 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  40.08 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 308 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  36.11 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 292 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  38.7 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  36.36 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  39.57 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  37.87 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  34.82 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  30.1 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  24.1 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  30.15 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  29.36 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.58 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  28.68 
 
 		 324 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  22.86 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.32 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  22.97 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  25.93 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>