More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7200 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  93.44 
 
 		 261 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  82.49 
 
 		 260 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  79.69 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  79.69 
 
 		 259 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  76.26 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  48.18 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 270 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  47.18 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 308 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 308 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  46 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  40.56 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  37.7 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  37.65 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  33.59 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  32.59 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.12 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.46 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.35 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.35 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.42 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  21.56 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>