More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1233 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 308 aa  553  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 308 aa  553  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  98.91 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  98.91 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 315 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 300 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 292 aa  407  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  75.6 
 
 		 257 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 257 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  69.63 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 272 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  72.22 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  59.92 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  49 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  49 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  48.44 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  47.27 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  46.69 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  40.82 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  41.6 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  36.8 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  34.94 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.05 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.77 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.36 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  26.91 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.89 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.89 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  27.52 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>