More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0227 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  99.23 
 
 
264 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  89.88 
 
 
259 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  83.92 
 
 
260 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  79.69 
 
 
261 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  79.07 
 
 
261 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
272 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  50.2 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
292 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
274 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
274 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
274 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
308 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
300 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  48 
 
 
257 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  48 
 
 
257 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  48 
 
 
257 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
300 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  48 
 
 
257 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
274 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  45.82 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  44.94 
 
 
253 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  43.78 
 
 
268 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  36.9 
 
 
288 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
289 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  39.84 
 
 
271 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
285 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  38.21 
 
 
258 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
272 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
252 aa  131  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  33.73 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  38.77 
 
 
258 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
256 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  29.68 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.85 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.75 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.51 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.11 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  26.85 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.11 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  31.25 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.31 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25.77 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>