More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2571 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  81.66 
 
 		 244 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  60.96 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  46.67 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  36.04 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  32.97 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  32.97 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  41.84 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  30.37 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  38.46 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  39.32 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.45 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  33.14 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  30.2 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  32.63 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.59 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.75 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3354  regulatory protein, IclR  28.25 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.532058  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  25.96 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.5 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.35 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  29.35 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.64 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.26 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.8 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  25.43 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.04 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  28.82 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3261  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  29.32 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  29.32 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3272  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3337  regulatory protein IclR  29.06 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.423625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3441  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0115656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  30.11 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.44 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  24.42 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3345  regulatory protein IclR  28.15 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20582  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>