More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1112 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  74.01 
 
 		 240 aa  315  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  45.71 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  44.98 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  41.51 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  37.08 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  36.21 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  37.93 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  37.93 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  40.98 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  28.93 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.45 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  30.1 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 256 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  21.62 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  26.9 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  26.24 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  26.24 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  20.5 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  31.94 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25.46 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  26.09 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  28.37 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.17 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.94 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  28.28 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>