More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0607 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2989  regulatory protein IclR  30.28 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.38 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.38 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.38 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.56 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.56 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.46 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.56 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.56 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  26.22 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  23.97 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  28.4 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  27.75 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  28.19 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  25.41 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.05 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.11 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  28.88 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  25.22 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  23.43 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>