224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1226 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  493  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.78 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.05 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  26.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  27.36 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  22 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  22 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  22 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  22 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  22 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  22 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  22 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  27.22 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  22.66 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.17 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  27.57 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.02 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  22.57 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  32.89 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.74 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  24.86 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>