261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4370 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  89.73 
 
 		 266 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  26.2 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  24.3 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  25.76 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  27.6 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  28.73 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.62 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.9 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.9 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  24.8 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  26.94 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.39 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.25 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  22.81 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  26.76 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  24 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2307  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 520 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  23.62 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.49 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  30 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.76 
 
 		 569 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  25.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  21.93 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  25.95 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  30.73 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.44 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  23.11 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  23.42 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  21.93 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.41 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  25.79 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>