More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2307 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2307  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 520 aa  1043    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  37.82 
 
 		 264 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 267 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  37.02 
 
 		 267 aa  143  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 267 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 267 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.39 
 
 		 278 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 261 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 267 aa  136  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 275 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 261 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 267 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 267 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 263 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  33.6 
 
 		 303 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  32.37 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.8 
 
 		 252 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.34 
 
 		 273 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 267 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 280 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  37.16 
 
 		 269 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  35.2 
 
 		 256 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 294 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  35.2 
 
 		 256 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  31.85 
 
 		 279 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 274 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 291 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 275 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  30.35 
 
 		 291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.35 
 
 		 291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  35.62 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  30.47 
 
 		 280 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  30.47 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 285 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 252 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 262 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.96 
 
 		 251 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 285 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 285 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 275 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  33.61 
 
 		 266 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 252 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 275 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 275 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  32.57 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  37.33 
 
 		 249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2753  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 244 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 261 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  30.83 
 
 		 255 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 274 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 266 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.84 
 
 		 261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.76 
 
 		 258 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.33 
 
 		 261 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.33 
 
 		 261 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 277 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  38.35 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 277 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 257 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 263 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.08 
 
 		 269 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 256 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 255 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 255 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 255 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 256 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.06 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  29.21 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 256 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 295 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 256 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 263 aa  100  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 281 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 256 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 264 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 256 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  98.2  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3684  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 254 aa  97.4  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 256 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 256 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 288 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 271 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 250 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  28.57 
 
 		 298 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>