More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1276 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  81.78 
 
 		 273 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  82.97 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  36.76 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 252 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.57 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  27.07 
 
 		 308 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.62 
 
 		 257 aa  89  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.49 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.37 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.79 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  31.11 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.66 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.49 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  31.82 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  26.54 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.36 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.76 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.3 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  28.62 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.72 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  29.67 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.48 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.87 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  22.91 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  26.18 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  32.5 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  26.52 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  24.14 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  24.14 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  30.8 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  24.14 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  24.14 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  24.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.9 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  24.14 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  24.75 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  26.98 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.46 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.97 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.86 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>