More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4941 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  41.5 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  37.4 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 252 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.98 
 
 		 252 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 251 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 251 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 258 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.91 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.03 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3112  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 250 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.02 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.04 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 257 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 255 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  26.4 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 261 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 254 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  25.09 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  26.72 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.18 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  29.41 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  28.11 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  26.98 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.84 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2705  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  26.48 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  31.22 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  31.28 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>