More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1639 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  98.69 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  81.78 
 
 		 271 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 301 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  37.89 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  25.99 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.69 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.64 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.4 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  24.36 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  25.75 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.36 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  25.45 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.47 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  23.86 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  28.3 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  25.85 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  25.63 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  23.88 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.81 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  28.14 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.97 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  29.44 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25.78 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25.78 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25.78 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25.78 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25.78 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  25.75 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.19 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  26.96 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  27.55 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>