More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3127 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  39.51 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  39.29 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  32.2 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.67 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.1 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  26.04 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.48 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.64 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.65 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  33.02 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5126  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.41 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.69 
 
 		 569 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  28.84 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.18 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.5 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  32.73 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.79 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.57 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.29 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.03 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  33.51 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  27.72 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  22.61 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  33.7 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.71 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  31.8 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.71 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.55 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>