More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0530 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  98.81 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  25.36 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  29.25 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  22.31 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 308 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  23.86 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  22.75 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  27.55 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.36 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 284 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  24.5 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.53 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  24.23 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  24.06 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.88 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  25 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  27.65 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  27.55 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  23.01 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  24.62 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  21.43 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  24.65 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  23.77 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.71 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.65 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  25.75 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  20.95 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  23.36 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  25.79 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  22.54 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  21.43 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 284 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  24.88 
 
 		 336 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 316 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>