More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0759 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  49.61 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  47.98 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  47.64 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  45.53 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  44.08 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  38.07 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  37.12 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  41.15 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  41.15 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  35.44 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  32.74 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.77 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  35.15 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.35 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.88 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.9 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  31.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.16 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.08 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  37.31 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 324 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  35.52 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  33.8 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.44 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  32.69 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>