More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2092 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  83.86 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  48.3 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  44.92 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0759  transcriptional regulator, IclR family  45.53 
 
 		 259 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  42.17 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  39.55 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.98 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.71 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.89 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.81 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.16 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.98 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.53 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  34.83 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  28.46 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  31.54 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  28.86 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.5 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  32.43 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  26.73 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  28.51 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0807  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.64 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  31.07 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  28.63 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  27.85 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  28.21 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0817  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.539423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  27.8 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.81 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>