286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51205 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  89.73 
 
 		 293 aa  470  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  26.57 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25.32 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.31 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  27.76 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5802  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0468871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  27.06 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.07 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2307  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 520 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  27.03 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.21 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  22.31 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.34 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  24.68 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5093  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.81 
 
 		 569 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.12 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  29.1 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  24.24 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  25 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  26.38 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  26.14 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  21.83 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  29.92 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  27.14 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.52 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6702  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.136407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>