More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1345 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  47.98 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  50.93 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  50.93 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  47.09 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  37.79 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  37.04 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  37.12 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  38.25 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  36.92 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  37.24 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  32.99 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  24.27 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  27.8 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  28.74 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.65 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  31.46 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.83 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  28.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  23.85 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.83 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  29.05 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  28.16 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>