More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3861 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  99.62 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  81.36 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  81.82 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  51 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  40.86 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  39.89 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  37.64 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  38.2 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  38.04 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  39.78 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.73 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  31.98 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  30.05 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.26 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  24.86 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  24.86 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.05 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.42 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  30.35 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.73 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  23.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  29.35 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  23.78 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.51 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  25.54 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25.94 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.82 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  32.26 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.34 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  30.88 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.34 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>