More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2902 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  52.26 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  51.13 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  56.28 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  56.28 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  52.43 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  38.7 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  38.86 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  43.26 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  42.47 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  40.96 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  33.82 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  32 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  28.81 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  20.25 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  27.4 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  30.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  30.2 
 
 		 288 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  27.32 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  27.32 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  28.35 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  27.49 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>