More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1905 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  47.06 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  45.87 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  44.27 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  42.04 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  48.66 
 
 		 210 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  42.61 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  42.61 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  38.89 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  39.2 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  44.5 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.37 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  38.5 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.45 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.39 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.85 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  31.77 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  26.25 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  30.92 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  39.16 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.96 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  30.77 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>