More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0931 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  65.61 
 
 		 273 aa  328  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  61.9 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  61.9 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  61.9 
 
 		 281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  61.9 
 
 		 315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  61.51 
 
 		 277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  61.9 
 
 		 315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  61.51 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  61.51 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  63.14 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  52.8 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.42 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.83 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  48.62 
 
 		 270 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.59 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.78 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.1 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.84 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.84 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  33.96 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  31.47 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 304 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  36.13 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  28.63 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  22.48 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.64 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  26.61 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  28.71 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3673  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.56 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.95 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0318  regulatory proteins, IclR  26.44 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000583044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  25.59 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.04 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  30.48 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.43 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  25 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.97 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>