173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3024 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  97.84 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  39.19 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.89 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  37 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.16 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.14 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.14 
 
 		 315 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  36.14 
 
 		 315 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.64 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.64 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  35.15 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  35.15 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  35.15 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.02 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.87 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.15 
 
 		 273 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.69 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  27.43 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.08 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  23.5 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  24 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.16 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4911  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.803448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.2 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  25.76 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  25.64 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56430  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2608  regulatory protein, IclR  27.92 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.28 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  30.5 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  27.4 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.07 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  26.21 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  34.44 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  29.8 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  27.95 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>