More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2330 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  82.89 
 
 		 296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  78.08 
 
 		 260 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  53.52 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  51.89 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.23 
 
 		 281 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.23 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.23 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  48.85 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  48.85 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  48.85 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  48.85 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  48.85 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.04 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  48.62 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.85 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.89 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.38 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  36.02 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.31 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  31.47 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  26.77 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  29.6 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.05 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  33.55 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  28.8 
 
 		 635 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  26.07 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.53 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  26.88 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  27.71 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  29.13 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.88 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2069  hypothetical protein  38.35 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.55 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  29.52 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  31.36 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  26.11 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>