47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2069 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  44.17 
 
 		 272 aa  84.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  37.27 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  36.15 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.35 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.59 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  37.21 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  34.33 
 
 		 285 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.55 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.17 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.59 
 
 		 264 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.23 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.23 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.23 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.23 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.23 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  27.42 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  27.42 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  33.61 
 
 		 299 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.68 
 
 		 273 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.43 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  27.91 
 
 		 266 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 268 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.04 
 
 		 273 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 304 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.95 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  38.24 
 
 		 274 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  41.18 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 288 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.61 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 261 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>