More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4534 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  82.89 
 
 		 270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  79.46 
 
 		 260 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  54.3 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  52.83 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.35 
 
 		 315 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.35 
 
 		 315 aa  261  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  47.35 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.62 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.62 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.62 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  49.23 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  49.23 
 
 		 277 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.43 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.42 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.9 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.8 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  34.29 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  37.64 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  34.12 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.53 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.88 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  31.93 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.23 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  27.62 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  28.18 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  28.05 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  30.49 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  25 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  29.34 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  28.14 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  27.09 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  27.31 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  26.95 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  30.34 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  26.95 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2069  hypothetical protein  33.59 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.7 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  28.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>