More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1748 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1748  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  70.67 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0846  transcriptional regulator, IclR family  52.46 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.731072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  53.92 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  38.46 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  30.53 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  34.19 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4050  regulatory protein, IclR  33.47 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.68 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.53 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  33.66 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 550 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.58 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.4 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  30.26 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0896  transcriptional regulator  50.59 
 
 		 91 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  33.67 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.43 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.19 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.87 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.76 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.76 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.76 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.07 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.65 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>