More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8160 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8160  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6236  IclR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4648  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5031  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4736  regulatory proteins, IclR  31.8 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5230  regulatory proteins, IclR  32.27 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4220  IclR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1528  regulatory protein, IclR  31.47 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2294  IclR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2341  transcriptional regulator PadR family protein  37.06 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2333  transcriptional regulator PadR family protein  37.06 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.0252833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3598  transcriptional regulator, IclR family  32.09 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0931  regulatory protein IclR  30.98 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  32.07 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  30.8 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  24.37 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  34.81 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.24 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.85 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  21.24 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.85 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  26.57 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  33.08 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.39 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  26.76 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.58 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  27.89 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  23.98 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  26.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  23.86 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  26.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  29.94 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  29.44 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  24.74 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  29.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>