More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6236 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6236  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8160  transcriptional regulator, IclR family  42.05 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4220  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2294  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2341  transcriptional regulator PadR family protein  34.09 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5230  regulatory proteins, IclR  34.62 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2333  transcriptional regulator PadR family protein  33.77 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.0252833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4648  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5031  regulatory proteins, IclR  34.32 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4736  regulatory proteins, IclR  34.75 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3598  transcriptional regulator, IclR family  37.02 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1528  regulatory protein, IclR  34.19 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0931  regulatory protein IclR  30.71 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  23.33 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.27 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.73 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  31.1 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.91 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.33 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  30.06 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  31.48 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  22.92 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  21.28 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3858  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.44 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2552  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.27 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  25.19 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  20 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1294  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  25.84 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  38.04 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  29.19 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.25 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56430  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4911  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.803448  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  29 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.57 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.57 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2750  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>