More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11801 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11801  transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  63.6 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  40 
 
 
259 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
257 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  31.02 
 
 
254 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
283 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  35.87 
 
 
255 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.56 
 
 
249 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
238 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.65 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 
244 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.82 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
265 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.09 
 
 
276 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  32.48 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  30.64 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.63 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.26 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.26 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.33 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  31.7 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  38.76 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.31 
 
 
275 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.39 
 
 
277 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.07 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.07 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  32.38 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.07 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  35.21 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  33.64 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.19 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.54 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.36 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.4 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  34.84 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  32.89 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  32.41 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.73 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  29.57 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>