More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4164 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4164  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000832407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  43.36 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  31.42 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  35.53 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  35.53 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  35.62 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.4 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  34.7 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  22.36 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  30.13 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  23.9 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  21.54 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  19.67 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  21.95 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  30.47 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.99 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.67 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.87 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  34.84 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  33.83 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  31.53 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>